Tubacin

カタログ番号 T6327 CAS 537049-40-4

Tubacin is a highly potent and selective, reversible, cell-permeable HDAC6 inhibitor with an IC50 of 4 nM, approximately 350-fold selectivity over HDAC1.

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Tubacin, CAS 537049-40-4

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生物学的特性に関する説明

化学的特性

保存条件 & 溶解度情報

説明	Tubacin is a highly potent and selective, reversible, cell-permeable HDAC6 inhibitor with an IC50 of 4 nM, approximately 350-fold selectivity over HDAC1.
ターゲット＆IC50	HDAC6 (cell-free assay):4nM
In vitro	Tubacin, without directly stabilizing microtubules, induces an increase in α-tubulin acetylation with EC50 of 2.5 μM in A549 cells. Tubacin inhibits HDAC6-mediated α-tubulin deacetylation, and inhibits the migration of both wild-type and HDAC6-overexpressing cells. Tubacin, in combination with paclitaxel, synergistically enhances tubulin acetylation. Tubacin significantly inhibits both drug-sensitive and drug–resistant MM cell growth with IC50 of 5–20 μM, and induces cell apoptosis by activation of caspases.
In vivo	In chick embryos, inhibition of HDAC6 activity by Tubacin reduces the formation of new blood vessels in matrigel/nylon mesh. In angioreactors implanted in mice, Tubacin also impairs the formation of new blood vessels.
キナーゼ試験	Enzyme Inhibition Assay:Enzyme inhibition assays are performed using the Reaction Biology HDAC Spectrum platform. The HDAC1, 2, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, and 11 assays used isolated recombinant human protein; HDAC3/NcoR2 complex is used for the HDAC3 assay. Substrate for HDAC1, 2, 3, 6, 10, and 11 assays is a fluorogenic peptide from p53 residues 379-382 (RHKKAc); substrate for HDAC8 is fluorogenic diacyl peptide based on residues 379-382 of p53 (RHKAcKAc). Acetyl-Lys(trifluoroacetyl)-AMC substrate is used for HDAC4, 5, 7, and 9 assays. Compounds are dissolved in DMSO and tested in 10-dose IC50 mode with 3-fold serial dilution starting at 30 μM. Control Compound Trichostatin A (TSA) is tested in a 10-dose IC50 with 3-fold serial dilution starting at 5 μM. IC50 values are extracted by curve-fitting the dose/response slopes.
細胞研究	Cell lines: Drug-sensitive (MM.1S,U266,INA-6,and RPMI8226) and drug-resistant (RPMI-LR5 and RPMI-Dox40) MM cell lines. Concentrations: ~20 μM. Incubation Time: 72 hours. Method:The inhibitory effect of bortezomib and/or tubacin on MM cell growth is assessed by measuring 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyl tetrazolium bromide (MTT) dye absorbance.All experiments are performed in quadruplicate.
動物実験	Animal Models: Athymic nude mice implanted with angioreactorsFormulation: DMSODosages: --Administration: Tubacin is filled in semiclosed angioreactors, and then implanted into the mice.

分子量	721.86
分子式	C41H43N3O7S
CAS No.	537049-40-4

保存条件

store at low temperature

Powder: -20°C for 3 years | In solvent: -80°C for 1 year

溶解度情報

DMSO: 93 mg/mL (128.8 mM)

Ethanol: <1 mg/mL

H2O: <1 mg/mL

参考文献

1. Butler KV, et al. J Am Chem Soc. 2010, 132(31), 10842-0846. 2. Haggarty SJ, et al. Proc Natl Acad Sci U S A. 2003, 100(8), 4389-4394. 3. Marcus AI, et al. Cancer Res. 2005, 65(9), 3883-3893. 4. Hideshima T, et al. Proc Natl Acad Sci U S A. 2005, 102(24), 8567-8572. 5. Li D, et al. Protein Cell. 2011, 2(2), 150-160. 6. Lu CY, et al. Tubacin, an HDAC6 Selective Inhibitor, Reduces the Replication of the Japanese Encephalitis Virus via the Decrease of Viral RNA Synthesis. Int J Mol Sci. 2017 May 1;18(5).

引用文献

1. Wang C, Huang M, Lin Y, et al.ENO2-derived phosphoenolpyruvate functions as an endogenous inhibitor of HDAC1 and confers resistance to antiangiogenic therapy.Nature Metabolism.2023: 1-22.

投与量変換

You can also refer to dose conversion for different animals. 詳細

In vivo投与量計算 (透明溶液)

ステップ1: 以下の情報を入力してください

投与量

mg/kg

動物の平均体重

動物あたりの投与量

動物数

溶媒の組成を入力してください

% DMSO+

% +

% Tween 80+

% ddH₂O

%DMSO+

計算するリセット

計算結果:

作業濃度: mg/ml;

DMSO溶液の作成方法: mg あらかじめ溶解した薬剤 μL DMSO (マスター溶液の濃度 mg/mL)，濃度がそのバッチの薬剤のDMSO溶解度を超える場合は、まずご連絡ください。

生体内薬剤の調合法：取る μL DMSO マスター溶液、次に追加 μL PEG300，確実に混ぜてから加える μL Tween 80，確実に混ぜてから加える μL ddH₂O, 確実に混ぜる

お問合せ内容:

必ず順番通りに溶媒を加えてください。ボルテックスミキサーや超音波、湯煎することで溶解しやすくなります

計算器

モル濃度計算機

希釈計算機

再構成計算

分子量計算機

質量

濃度

体積

分子量

モル度計算機では以下の計算が可能です

既知の体積と濃度の溶液を調製するために必要な化合物の質量
質量が既知の化合物を目的の濃度まで溶解させるのに必要な溶液の量
特定の体積の中に既知の質量の化合物を入れて得られる溶液の濃度

参考例

モル濃度計算機を使用したモル濃度計算の例
化合物の分子量が197.13g/molである場合、10mlの水に10mMのストック溶液を作るのに必要な化合物の質量はどれくらいですか？
［分子量（MW）］の欄に［197.13］と入力してください
[濃度]ボックスに10と入力し、正しい単位（millimolar）を選択します
[容量]ボックスに10と入力し、正しい単位（milliliter）を選択します
計算を押します
答えの19.713mgが質量欄に表示されます

濃度 (開始)

体積 (開始)

濃度 (終了)

体積 (終了)

溶液を作るのに必要な希釈率の計算

溶液の調製に必要な希釈率の算出
希釈計算機は、既知の濃度の原液をどのように希釈するかを計算することができる便利なツールです。V1を計算するためにC1、C2＆V2を入力します。

参考例

Tocrisの希釈計算器を用いた希釈計算の一例
50μMの溶液を20ml作るためには、10mMの原液を何ml必要ですか？
C1V1=C2V2という式を用いて、C1=10mM、C2=50μM、V2=20ml、V1を未知数とします。
濃度（開始）ボックスに10を入力し正しい単位(millimolar)を選択してください
濃度（終了）ボックスに50を入力し正しい単位(millimolar)を選択してください
体積（終了）ボックスに20を入力し正しい単位(millimolar)を選択してください
計算を押します
100 microliter (0.1 ml) という答えが体積（開始）ボックスに表示されます。

分子式

分子量 g/mol

化合物の化学式を入力して、そのモル質量や元素組成を計算します

Tヒント：化学式は大文字と小文字を区別します。: C10H16N2O2 c10h16n2o2

化合物のモル質量（分子量）を計算する手順:
化学物質のモル質量を計算するには、その化学式を入力し、「計算」をクリックしてください。.
分子質量、分子量、モル質量、モル重量の定義:
分子質量（分子量）とは、物質の1分子の質量であり、統一された原子質量単位（u）で表されます。(1uは炭素12の1原子の質量の1/12に等しい）
モル質量（molar weight）とは、ある物質の1モルの質量のことで、単位はg/molです。

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Keywords

Tubacin 537049-40-4 Chromatin/Epigenetic DNA Damage/DNA Repair Microbiology/Virology Virus Protease HDAC Inhibitor inhibit Histone deacetylases inhibitor

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